1、轨道式摇床用水选纯水、蒸馏水，避免使用河水、井水等硬水。如果使用的是自来水，为防止水垢积聚，不影响恒温灵敏度，每次使用完毕后应及时对设备进行清洁。
2、放置摇瓶时应注意以下几点：①摇瓶均匀对称放置；②为了防止摇瓶浮动，装液量不能过少；③为防止水珠滴入摇瓶，应保证摇瓶口密封良好。
3、设备在高速运转过程中可能会发生一定的位移（摇瓶合理对称放置更稳定），建议安排专人看管。如果培养的是贵重菌种，为避免不必要的损失更应勤加观察。一旦发现异常情况，果断切断电源。
4、设备运转过程中，箱体内的电器部分不要用手触摸、用水冲洗、用湿布擦洗。
5、为延长设备使用寿命，使用过程中避免频繁更改温度、振幅等数值，否则压缩机启动次数过多易造成过载。
6、为延长灯管使用寿命，在箱体无照明需求时可以将照明开关关闭，这样也可以避免影响上层温度。
7、不要触碰箱体内的感温探头，否则易造成温度失控。温度控制仪精密复杂，非专业人员不要轻易打开。
8、使用、清洁、保养设备时，应注意保护箱体漆面，否则会影响整体美观度。
9、设备使用一段时间后，电刷会有一定程度的磨损，甚至会影响其正常使用。这时候就需要对电刷进行更换。更换完毕再次使用时，为研磨电刷请保证电机轻载低速（100r/mjn）运行八小时。然后用干净的纱布沾取适量乙醇溶液清洁换向器表面及刷捏盒内表面。
